Ле Пен народився в маленькому селі на атлантичному узбережжі Франції, в провінції Бретань, в родині рибалки і кравчині. У 1942 він осиротів, коли його батько підірвався на міні під час рибалки і Ле Пен став так званим "національним сиротою" (фр. pupille de la nation), тобто виховувався на державні кошти. На кошти держави він навчався у єзуїтській школі. Під час німецької окупіації Ле Пен намагався приєднатися до руху опору, але йому відмовили. Після закінчення ліцею він поступив на юридичний факультет в Парижі і став головою студентської асоціації факультету.
У 50-і рр.. Ле Пен був активістом націоналістичних організацій. В одній з вуличних бійок з комуністами йому пошкодили ліве око, до якого зір так і не повернулося.
У 1953 році організував групу студентів-добровольців для допомоги населенню Нідерландів, постраждалому від масштабної повені.
Після закінчення університету Ле Пен пішов на службу до Іноземного Легіону і у 1954 був направлений до Індокитаю. Свою службу у легіоні він продовжив на Суецькому каналі, вже після укладення перемир'я. У 1957 Ле Пен служив у французькій розвідці в Алжирі. Його політичні супротивники звинувачували його в причетності до тортур алжирських повстанців, але ці звинувачення не були доведені і сам Ле Пен їх категорично заперечував.
Після закінчення служби він продовжив своє навчання на юридичному факультеті і згодом почав вивчати ще й політологію. Після поразки на парламентських виборах 1962 року Ле Пен займався підприємництвом - організував звукозаписну компанію SERP (фр. Societe d'etude et de relations publiques, укр. Товариство вивчення суспільних відносин).
26 червня 1960 він одружився з П'єретт Лола (фр. Pierrette Lalanne) — в них народилося 3 дочки. У 1985 (за іншими даними - в 1984 або 1986) році він розлучився з першою дружиною П'єретт Лала. Від першого шлюбу в нього три дочки і дев'ять онуків. Повторно одружився 31 травня 1991 із Жанна-Марі (Жані) Пашо (фр. Jeanne-Marie Paschos dite Jany). Одна з дочок Ле Пена, Марін (Marine Le Pen), стала його найближчою політичної соратницею, зокрема взяла активну участь в кампанії 2007 року.